to
×2 ÷2 Center the view on the reference gene Shift 1 gene on the left Shift 5 genes on the left Shift 1 gene on the right Shift 5 genes on the right Zoom out Show 1 less gene on each side Show 1 more gene on each side Show half the number of genes on each side Show twice more genes on each side Zoom in
Schematic scale
Genomic scale

dN/dS Ratio
Protein Similarity
CNE Track
36_Chordata duplication node (click to collapse) 36_Chordata Click to show this node (36_Chordata) 36_Chordata duplication node (click to collapse) Click to show this node (36_Chordata) 36_Chordata speciation node (click to collapse) Click to show this node (32_Olfactores) 32_Olfactores speciation node (click to collapse) Click to show this node (20_Ascidiacea) 20_Ascidiacea duplication node (click to collapse) Click to hide this line (20_Ascidiacea) 20_Ascidiacea speciation node (click to collapse) 20_Ascidiacea - block_438 Click to hide this line (19_Phlebobranchia) 19_Phlebobranchia speciation node (click to collapse) 19_Phlebobranchia - block_558 Click to hide this line (15_Ciona) 15_Ciona speciation node (click to collapse) 15_Ciona - block_880 Click to hide this line (Cirobu) Cirobu terminal node Cirobu - Chr:KhC2 Click to hide this line (Cisavi) Cisavi terminal node Cisavi - Chr:R17 Cisavi.g00003417,CX030,ENSCSAVG00000004810 (Cisavi.CG.ENS81.R17.536717-539205) Cisavi.g00003419,ENSCSAVG00000004816,TMCO4 (Cisavi.CG.ENS81.R17.551592-558470) Cisavi.g00003420,ENSCSAVG00000004851 (Cisavi.CG.ENS81.R17.559163-570097) Cisavi.g00003421,AZIN1,AZIN2,DCOR,ENSCSAVG00000005190 (Cisavi.CG.ENS81.R17.575996-587144) Cisavi.g00003422,ENSCSAVG00000005222 (Cisavi.CG.ENS81.R17.593722-596424) Cisavi.g00003423,CDKL1,CDKL2,CDKL4,CDKL5,ENSCSAVG00000005254 (Cisavi.CG.ENS81.R17.597258-603448) Cisavi.g00003424,ENSCSAVG00000005273 (Cisavi.CG.ENS81.R17.603853-608608) Cisavi.g00003425,COQ2,ENSCSAVG00000005284 (Cisavi.CG.ENS81.R17.608776-613196) Cisavi.g00003426,ENSCSAVG00000005287 (Cisavi.CG.ENS81.R17.618113-621427) Cisavi.g00003427,ENSCSAVG00000005289 (Cisavi.CG.ENS81.R17.622702-628247) Cisavi.g00003428,ENSCSAVG00000005394,ERCC5,GEN (Cisavi.CG.ENS81.R17.628338-639143) Cisavi.g00003429,ENSCSAVG00000005472 (Cisavi.CG.ENS81.R17.639860-640327) Cisavi.g00003431,CNGA1,CNGA2,CNGA3,ENSCSAVG00000005479 (Cisavi.CG.ENS81.R17.647840-654588) Cisavi.g00003432,ENSCSAVG00000005604 (Cisavi.CG.ENS81.R17.656603-661439) Cisavi.g00003435,EA3L1,ELOA1,ELOA3,ENSCSAVG00000005624 (Cisavi.CG.ENS81.R17.703893-707508) Cisavi.g00003436,ENSCSAVG00000005625 (Cisavi.CG.ENS81.R17.708151-712352) Cisavi.g00003437,ENSCSAVG00000005631 (Cisavi.CG.ENS81.R17.715213-725451) Cisavi.g00003438,ENSCSAVG00000005641,LARP6 (Cisavi.CG.ENS81.R17.735735-737822) Cisavi.g00003439,ENSCSAVG00000005642 (Cisavi.CG.ENS81.R17.737716-738188) Cisavi.g00003440,ENSCSAVG00000005644,TBC15,TBC16,TBC17 (Cisavi.CG.ENS81.R17.739425-750261) Cisavi.g00003441,ENSCSAVG00000005683,PED1A,PED1B (Cisavi.CG.ENS81.R17.751188-756581) Cisavi.g00003442,ENSCSAVG00000005700 (Cisavi.CG.ENS81.R17.772473-775287) Cisavi.g00003443,ENSCSAVG00000005703,FUCO,FUCO2 (Cisavi.CG.ENS81.R17.787960-791032) Cisavi.g00003444,ENSCSAVG00000005884,PLCC,PLCD,PLCE (Cisavi.CG.ENS81.R17.794534-798111) Cisavi.g00003445,ENSCSAVG00000005917,PNCB (Cisavi.CG.ENS81.R17.803805-813572) Cisavi.g00003446,ENSCSAVG00000006335,UROM (Cisavi.CG.ENS81.R17.815892-821161) Cisavi.g00003447,ENSCSAVG00000006342,ST1C2,ST1C3,ST2A1 (Cisavi.CG.ENS81.R17.826793-827865) Cisavi.g00003448,CE022,ENSCSAVG00000006354 (Cisavi.CG.ENS81.R17.836868-841689) Cisavi.g00003449,ENSCSAVG00000006379,F10C1 (Cisavi.CG.ENS81.R17.841785-845462) Click to hide this line (18_Phallusia) 18_Phallusia speciation node (click to collapse) 18_Phallusia - block_553 Fam010608.a.b Click to hide this line (Phmamm) Phmamm terminal node Phmamm - Chr:S128 Phmamm.g00003800,MPC1,MPC1L (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03800) Phmamm.g00003801,CDKL2,CDKL4,CDKL5 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03801) Phmamm.g00003802,COQ2 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03802) Phmamm.g00003804,SYRC (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03804) Phmamm.g00003807,LTOR1 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03807) Phmamm.g00003808,CFA97 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03808) Phmamm.g00003809,CNGA1,CNGA2,CNGA3 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03809) Phmamm.g00003810 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03810) Phmamm.g00003811,SYS1 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03811) Phmamm.g00003812,ERCC5,FEN1 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03812) Phmamm.g00003813,ESTD (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03813) Phmamm.g00003814 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03814) Phmamm.g00003815,TM9S1,TM9S3,TM9S4 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03815) Phmamm.g00003816,NOL9 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03816) Phmamm.g00003817,PKHB1 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03817) Phmamm.g00003818,ADH1B,ADH4,ADHX (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03818) Phmamm.g00003819,AGRD1,AGRD2,LPHN3 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03819) Phmamm.g00003820 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03820) Click to hide this line (Phfumi) Phfumi terminal node Phfumi - Chr:S4550 Click to show this node (12_Stolidobranchia) 12_Stolidobranchia speciation node (click to collapse) Click to hide this line (11_Molgula) 11_Molgula speciation node (click to collapse) 11_Molgula - block_145 Fam011602 Click to show this node (9) 9 speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Moocul) Moocul terminal node Moocul - Chr:S45502 Moocul.g00002446,ARMC4,CLUH (Moocul.CG.ELv1_2.S45502.g02446) Moocul.g00002449,SLC26A11,SLC26A5,SLC26A6 (Moocul.CG.ELv1_2.S45502.g02449) Moocul.g00002450 (Moocul.CG.ELv1_2.S45502.g02450) Moocul.g00002451,PTPN14,PTPN21,PTPRZ1 (Moocul.CG.ELv1_2.S45502.g02451) Click to hide this line (Moocci) Moocci terminal node Moocci - Chr:S543820 Moocci.g00020914,BRSK1,BRSK2,SIK3 (Moocci.CG.ELv1_2.S543820.g20914) Moocci.g00020915 (Moocci.CG.ELv1_2.S543820.g20915) Moocci.g00020916,EPB41L4A,EPB41L4B,EPB41L5 (Moocci.CG.ELv1_2.S543820.g20916) Moocci.g00020917 (Moocci.CG.ELv1_2.S543820.g20917) Moocci.g00020918,EPB41L4A,EPB41L4B,EPB41L5 (Moocci.CG.ELv1_2.S543820.g20918) Moocci.g00020919 (Moocci.CG.ELv1_2.S543820.g20919) Moocci.g00020920,SLC26A11,SLC26A4,SLC26A5 (Moocci.CG.ELv1_2.S543820.g20920) Moocci.g00020922,HELZ,HELZ2,UPF1 (Moocci.CG.ELv1_2.S543820.g20922) Click to show this node (20_Ascidiacea) 20_Ascidiacea speciation node (click to collapse) Click to show this node (12_Stolidobranchia) 12_Stolidobranchia speciation node (click to collapse) Click to hide this line (6) 6 speciation node (click to collapse) 6 - block_270 Fam011602 Click to hide this line (5_Halocynthia) 5_Halocynthia speciation node (click to collapse) 5_Halocynthia - block_484 Fam011602 Fam011039 Fam009830.b Click to hide this line (Haaura) Haaura terminal node Haaura - Chr:S412 Haaura.g00004897,CEP135,GOLGB1,TSGA10 (Haaura.CG.MTP2014.S412.g04897) Haaura.g00004898,ITIH5,VWA3A,VWA3B (Haaura.CG.MTP2014.S412.g04898) Haaura.g00004900 (Haaura.CG.MTP2014.S412.g04900) Click to hide this line (Harore) Harore terminal node Harore - Chr:S81 Harore.g00004406,KCNK12,KCNK13,KCNK16 (Harore.CG.MTP2014.S81.g04406) Harore.g00002160,FUS,TAF15 (Harore.CG.MTP2014.S81.g02160) Harore.g00007028 (Harore.CG.MTP2014.S81.g07028) Harore.g00003087,AC097637.1,TWF1,TWF2 (Harore.CG.MTP2014.S81.g03087) Harore.g00012141,EFS,PEX13,SH3D19 (Harore.CG.MTP2014.S81.g12141) Harore.g00000046,EFS,PEX13,SH3D19 (Harore.CG.MTP2014.S81.g00046) Harore.g00011337,EXOC1,STXBP6 (Harore.CG.MTP2014.S81.g11337) Harore.g00004900,SLC40A1 (Harore.CG.MTP2014.S81.g04900) Harore.g00015261,LRGUK,LRRC49,PPP1R7 (Harore.CG.MTP2014.S81.g15261) Harore.g00001136,LRRC49 (Harore.CG.MTP2014.S81.g01136) Harore.g00006109,SLC24A2,SLC24A3,SLC24A4 (Harore.CG.MTP2014.S81.g06109) Harore.g00015048 (Harore.CG.MTP2014.S81.g15048) Harore.g00011846,CEP135,GOLGB1,TSGA10 (Harore.CG.MTP2014.S81.g11846) Harore.g00011123,ITIH5,VWA3A,VWA3B (Harore.CG.MTP2014.S81.g11123) Harore.g00000986,MICU1,MICU2,MICU3 (Harore.CG.MTP2014.S81.g00986) Harore.g00003585 (Harore.CG.MTP2014.S81.g03585) Harore.g00012752,CELSR1,CELSR2,CELSR3 (Harore.CG.MTP2014.S81.g12752) Harore.g00006247,DYSF,FER1L5,MYOF (Harore.CG.MTP2014.S81.g06247) Harore.g00013728,BBS9 (Harore.CG.MTP2014.S81.g13728) Harore.g00004498,HSD17B11,RDH10,SDR16C5 (Harore.CG.MTP2014.S81.g04498) Harore.g00011686,GSTA2,GSTA3,HPGDS (Harore.CG.MTP2014.S81.g11686) Harore.g00005563,GSTA2,GSTP1,HPGDS (Harore.CG.MTP2014.S81.g05563) Harore.g00008339,GGNBP2 (Harore.CG.MTP2014.S81.g08339) Harore.g00014684,PGPEP1,PGPEP1L (Harore.CG.MTP2014.S81.g14684) Harore.g00006282 (Harore.CG.MTP2014.S81.g06282) Harore.g00011988,SAMHD1 (Harore.CG.MTP2014.S81.g11988) Harore.g00009244 (Harore.CG.MTP2014.S81.g09244) Harore.g00007109,CBS,SDS,SRR (Harore.CG.MTP2014.S81.g07109) Click to show this node (2_Styelidae) 2_Styelidae speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Boleac) Boleac terminal node Boleac - Chr:S267 Boleac.g00006310,BBS9 (Boleac.CG.SB_v3.S267.g06310) Boleac.g00006311,BBS9 (Boleac.CG.SB_v3.S267.g06311) Boleac.g00006312 (Boleac.CG.SB_v3.S267.g06312) Boleac.g00006315,DYSF,FER1L5,MYOF (Boleac.CG.SB_v3.S267.g06315) Click to hide this line (36_Chordata) 36_Chordata speciation node (click to collapse) 36_Chordata - block_497 Click to show this node (32_Olfactores) 32_Olfactores speciation node (click to collapse) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata duplication node (click to collapse) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) Click to show this node (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota duplication node (click to collapse) Click to hide this line (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) 28_Amniota - block_1 Fam009988.c.a.a Fam012684.b.a.b.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b Fam011821.a.a Fam005349.B Fam007903.a.b Fam004797.A.a Fam013287.b.a.b.b.b Fam008247.b.b Fam009830 Fam011913.b Fam014723.a.b Fam008075 Fam011704.c.b Fam012490.b.b.a Fam012490.a Fam008891.a Fam009123.c.a.b.a Fam005334.D.a Fam008963.c.a Fam008749.b.a.a.b Fam005286.a Fam013450.d.b Fam005106.O.d Fam003487 Fam009715.a.a Fam005130.E.d.b Fam007743.a Fam005400.S.b.b Fam008422.b Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Ggal) Ggal terminal node Ggal - Chr:4 FAT1 (ENSGALG00000013579) ENSGALG00000013590 ASAH1 (ENSGALG00000026364) ENSGALG00000013600 PCM1 (ENSGALG00000013602) FGL1 (ENSGALG00000013606) ENSGALG00000023068 ENSGALG00000013615 PDGFRL (ENSGALG00000013617) SLC7A2 (ENSGALG00000013627) ENSGALG00000013641 VPS37A (ENSGALG00000013646) CNOT7 (ENSGALG00000013649) ENSGALG00000013655 TUSC3 (ENSGALG00000013674) SGCZ (ENSGALG00000013684) DLC1 (ENSGALG00000013715) ENSGALG00000026794 LONRF1 (ENSGALG00000013725) PAICS (ENSGALG00000013726) PPAT (ENSGALG00000013728) AASDH (ENSGALG00000013764) KIAA1211 (ENSGALG00000013771) CEP135 (ENSGALG00000013776) EXOC1 (ENSGALG00000013778) EXOC1L (ENSGALG00000026176) NMU (ENSGALG00000020151) PDCL2 (ENSGALG00000013783) CLOCK (ENSGALG00000013793) Click to hide this line (27_Euarchontoglires) 27_Euarchontoglires speciation node (click to collapse) 27_Euarchontoglires - block_13 Fam012368.A.b.a.a.b Fam005400.S.b.b Fam008133.b.b Fam007743.a Fam005130.E.d.b Fam003487 Fam005106.O.d Fam013450.d.b Fam005286.a Fam008749.b.a.a.b Fam008963.c.a Fam005334.D.a Fam009123.c.a.b.a Fam008891.a Fam004763.D.b.a Fam006121.b.a.a Fam013469 Fam012490.b.b.a Fam011704.c.b Click to hide this line (Hsap) Hsap terminal node Hsap - Chr:8 DEFB134 (ENSG00000205882) DEFB130B (ENSG00000233050) ZNF705D (ENSG00000215343) USP17L7 (ENSG00000226430) USP17L2 (ENSG00000223443) FAM86B1 (ENSG00000186523) DEFB130A (ENSG00000232948) FAM86B2 (ENSG00000145002) LONRF1 (ENSG00000154359) TRMT9B (ENSG00000250305) DLC1 (ENSG00000164741) C8orf48 (ENSG00000164743) SGCZ (ENSG00000185053) TUSC3 (ENSG00000104723) MSR1 (ENSG00000038945) ZDHHC2 (ENSG00000104219) CNOT7 (ENSG00000198791) VPS37A (ENSG00000155975) MTMR7 (ENSG00000003987) SLC7A2 (ENSG00000003989) PDGFRL (ENSG00000104213) MTUS1 (ENSG00000129422) FGL1 (ENSG00000104760) PCM1 (ENSG00000078674) ASAH1 (ENSG00000104763) NAT1 (ENSG00000171428) NAT2 (ENSG00000156006) PSD3 (ENSG00000156011) SH2D4A (ENSG00000104611) Click to hide this line (Mmus) Mmus terminal node Mmus - Chr:8 Dusp4 (ENSMUSG00000031530) Tnks (ENSMUSG00000031529) Ppp1r3b (ENSMUSG00000046794) Eri1 (ENSMUSG00000031527) Mfhas1 (ENSMUSG00000070056) Gm19410 (ENSMUSG00000109372) Cldn23 (ENSMUSG00000055976) Prag1 (ENSMUSG00000050271) Lonrf1 (ENSMUSG00000039633) Trmt9b (ENSMUSG00000039620) Dlc1 (ENSMUSG00000031523) AI429214 (ENSMUSG00000074384) Sgcz (ENSMUSG00000039539) Tusc3 (ENSMUSG00000039530) Msr1 (ENSMUSG00000025044) Zdhhc2 (ENSMUSG00000039470) Cnot7 (ENSMUSG00000031601) Vps37a (ENSMUSG00000031600) Mtmr7 (ENSMUSG00000039431) Adam24 (ENSMUSG00000046723) Adam25 (ENSMUSG00000071937) Adam20 (ENSMUSG00000046282) Adam39 (ENSMUSG00000054033) Slc7a2 (ENSMUSG00000031596) Pdgfrl (ENSMUSG00000031595) Mtus1 (ENSMUSG00000045636) Fgl1 (ENSMUSG00000031594) Pcm1 (ENSMUSG00000031592) Asah1 (ENSMUSG00000031591) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Psin) Psin terminal node Psin - Chr:JH210278.1 ENSPSIG00000001970 TUSC3 (ENSPSIG00000010076) ZDHHC2 (ENSPSIG00000011920) CNOT7 (ENSPSIG00000012569) VPS37A (ENSPSIG00000012789) MTMR7 (ENSPSIG00000013401) SLC7A2 (ENSPSIG00000014516) PDGFRL (ENSPSIG00000015518) MTUS1 (ENSPSIG00000015978) FGL1 (ENSPSIG00000017107) PCM1 (ENSPSIG00000017418) ENSPSIG00000017561 ASAH1 (ENSPSIG00000017567) ENSPSIG00000017971 ENSPSIG00000001972 FAT1 (ENSPSIG00000006082) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata duplication node (click to collapse) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) Click to show this node (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Lcha) Lcha terminal node Lcha - Chr:JH127134.1 mtus1a (ENSLACG00000001928) PDGFRL (ENSLACG00000002969) SLC7A2 (ENSLACG00000004392) MTMR7 (ENSLACG00000007217) CNOT7 (ENSLACG00000009460) ZDHHC2 (ENSLACG00000010328) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata duplication node (click to collapse) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata duplication node (click to collapse) Click to hide this line (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) 31_Gnathostomata - block_9 Fam004875.a Fam010227.b.a Fam012133 Fam005135.E.a.a.b.a Fam005353 Fam007475.b.a Fam009754.b.b Fam008067.a Fam008303.f Fam003875.C.a.b Fam010383 Fam008963.d.b Fam012577.a.a Fam005103.JB.b.b.b.b.b.a.a Fam013425.b.b.b Fam005208 Fam008891.b.a Fam007304.b Fam005225.A.a Click to show this node (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) Click to hide this line (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) 28_Amniota - block_3 Fam012133.a.b Fam005135.E.a.a.b.a Fam005353.b Fam007475.b.a.b.a.a Fam005293.G.b.a.b.b.a.a.b.a Fam009754.b.b Fam008067.a.b Fam008303.f Fam003875.C.a.b.b Fam010383 Fam008963.d.b Fam012577.a.a.a Fam005103.JB.b.b.b.b.b.a.b Fam008665.a Fam013425.b.b.b Fam005208 Fam008891.b.a Fam007304.b.b.a Fam005225.A.a Fam011317.a Fam005694.E Fam007762.a Fam008206.b.a Fam005020.B.d.a Fam009876.a Fam013764.c Fam005307.E Fam013133.b.b.b Fam013149.a.b.a Fam009583.d Click to hide this line (27_Euarchontoglires) 27_Euarchontoglires speciation node (click to collapse) 27_Euarchontoglires - block_20 Fam013764.c Fam009876.a Fam005020.B.d.b Fam005020.B.d.a Fam008206.b.a Fam007762.a Fam005694.E Fam011317.a Fam005225.A.a Fam007304.b.b.a Fam012902.a Fam008891.b.a Fam005208 Fam013425.b.b.b Fam008665.a Fam005103.JB.b.b.b.b.b.a.b Fam012577.a.a.a Fam008963.d.b Fam010383 Fam008303.f Fam003875.C.a.b.b Fam008067.a.b Fam009754.b.b Fam005293.G.b.a.b.b.a.a.b.b Fam007475.b.a.b.b Fam005353.a Fam005135.E.a.a.b.a Fam012133.a.b Click to hide this line (Mmus) Mmus terminal node Mmus - Chr:14 Gja3 (ENSMUSG00000048582) Gjb2 (ENSMUSG00000046352) Gm4491 (ENSMUSG00000089840) Gjb6 (ENSMUSG00000040055) Cryl1 (ENSMUSG00000021947) Ift88 (ENSMUSG00000040040) Il17d (ENSMUSG00000050222) Eef1akmt1 (ENSMUSG00000021951) Xpo4 (ENSMUSG00000021952) Lats2 (ENSMUSG00000021959) Sap18 (ENSMUSG00000021963) Ska3 (ENSMUSG00000021965) Mrpl57 (ENSMUSG00000021967) Zdhhc20 (ENSMUSG00000021969) Micu2 (ENSMUSG00000021973) ENSMUSG00000059835 1700129C05Rik (ENSMUSG00000021977) Gm5142 (ENSMUSG00000053868) Rcbtb1 (ENSMUSG00000035469) Gm6904 (ENSMUSG00000090881) Phf11a (ENSMUSG00000044703) Phf11b (ENSMUSG00000091649) Phf11d (ENSMUSG00000068245) Phf11c (ENSMUSG00000091144) Setdb2 (ENSMUSG00000071350) Cab39l (ENSMUSG00000021981) Cdadc1 (ENSMUSG00000021982) Shisa2 (ENSMUSG00000044461) Atp8a2 (ENSMUSG00000021983) ENSMUSG00000086112 Click to hide this line (Hsap) Hsap terminal node Hsap - Chr:13 ZMYM2 (ENSG00000121741) GJA3 (ENSG00000121743) GJB2 (ENSG00000165474) GJB6 (ENSG00000121742) CRYL1 (ENSG00000165475) IFT88 (ENSG00000032742) IL17D (ENSG00000172458) EEF1AKMT1 (ENSG00000150456) XPO4 (ENSG00000132953) LATS2 (ENSG00000150457) SAP18 (ENSG00000150459) SKA3 (ENSG00000165480) MRPL57 (ENSG00000173141) ZDHHC20 (ENSG00000180776) MICU2 (ENSG00000165487) ENSG00000279282 ENSG00000280175 SGCG (ENSG00000102683) SACS (ENSG00000151835) TNFRSF19 (ENSG00000127863) MIPEP (ENSG00000027001) C1QTNF9B (ENSG00000205863) SPATA13 (ENSG00000182957) C1QTNF9 (ENSG00000240654) ENSG00000281899 PARP4 (ENSG00000102699) ATP12A (ENSG00000075673) RNF17 (ENSG00000132972) CENPJ (ENSG00000151849) PABPC3 (ENSG00000151846) Click to hide this line (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) 24_Archelosauria - block_5 Fam009583.d Fam013149.a.b.a Fam013133.b.b.b Fam005307.E Fam013764.c Fam009876.a Fam005020.B.d.a Fam008206.b.a Fam007762.a Fam005694.E Fam011317.a Fam005225.A.a Fam007304.b.b.a Fam008891.b.a Fam005208 Fam013425.b.b.b Fam008665.a Fam005103.JB.b.b.b.b.b.a.b Fam012577.a.a.a Fam008963.d.b Fam010383 Fam003875.C.a.b.a Fam008303.f Fam008067.a.b Fam009754.b.b Fam005293.G.b.a.b.b.a.a.b.a Fam007475.b.a.b.a.a Fam005353.b Fam005135.E.a.a.b.a Fam012133.a.b Click to hide this line (Ggal) Ggal terminal node Ggal - Chr:1 GPR12 (ENSGALG00000017102) WASF3 (ENSGALG00000017103) ENSGALG00000017104 RNF6 (ENSGALG00000017105) ATP8A2 (ENSGALG00000017106) ENSGALG00000026714 NUP58 (ENSGALG00000017111) MTMR6 (ENSGALG00000017112) AMER2 (ENSGALG00000027868) ENSGALG00000019077 ENSGALG00000017117 MIPEP (ENSGALG00000017118) TNFRSF19 (ENSGALG00000017119) SACS (ENSGALG00000017120) SGCG (ENSGALG00000017122) MICU2 (ENSGALG00000017125) ZDHHC20 (ENSGALG00000017126) SKA3 (ENSGALG00000017128) SAP18 (ENSGALG00000017129) ENSGALG00000017130 XPO4 (ENSGALG00000017132) EEF1AKMT1 (ENSGALG00000017133) ENSGALG00000017134 CRYL1 (ENSGALG00000017135) GJB6 (ENSGALG00000017136) GJB2 (ENSGALG00000022720) GJA3 (ENSGALG00000017137) ENSGALG00000017139 PSPC1 (ENSGALG00000017142) MPHOSPH8 (ENSGALG00000017145) Click to hide this line (Psin) Psin terminal node Psin - Chr:JH224662.1 ENSPSIG00000001783 ENSPSIG00000001785 CRYL1 (ENSPSIG00000005898) IFT88 (ENSPSIG00000006089) IL17D (ENSPSIG00000006615) EEF1AKMT1 (ENSPSIG00000006619) XPO4 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(SINCAMG00000009309) SACS (SINCAMG00000009312) SGCG (SINCAMG00000009313) NULL (SINCAMG00000017237) MICU2 (SINCAMG00000009317) ZDHHC20 (SINCAMG00000009322) SKA3 (SINCAMG00000009326) SAP18 (SINCAMG00000009329) LATS2 (SINCAMG00000009330) Click to hide this line (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) 31_Gnathostomata - block_384 Fam008019 Fam007495.a Fam008891.b.b Fam005714.A Fam006121.b.b Click to hide this line (Cmil) Cmil terminal node Cmil - scaffold_2 GRIA3 (SINCAMG00000016204) NULL (SINCAMG00000017758) UPRT (SINCAMG00000016229) FLT1 (SINCAMG00000016232) CDX4 (SINCAMG00000016250) Chic1 (SINCAMG00000016253) FIP1L1 (SINCAMG00000016255) LNX2 (SINCAMG00000016270) zgc:110179 (SINCAMG00000016275) WASF3 (SINCAMG00000016277) SLC16A2 (SINCAMG00000016280) rnf12-a (SINCAMG00000016284) KIAA2022 (SINCAMG00000016286) Abcb7 (SINCAMG00000016287) ZDHHC15 (SINCAMG00000016291) ATRX (SINCAMG00000016294) MAGT1 (SINCAMG00000016308) wnt11b (SINCAMG00000016311) GUCY2F (SINCAMG00000016315) NXT2 (SINCAMG00000016318) ACSL4 (SINCAMG00000016319) TMEM164 (SINCAMG00000016326) AMMECR1 (SINCAMG00000016329) CHRDL1 (SINCAMG00000016335) pak3 (SINCAMG00000016339) CAPN5 (SINCAMG00000016344) DCX (SINCAMG00000016348) Alg13 (SINCAMG00000016352) ALG13 (SINCAMG00000016355) Click to hide this line (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) 29_Sarcopterygii - block_78 Fam008019 Fam008891.b.b Fam005714.A Fam006121.b.b Fam007404.a.b.a Fam005675.B.a.a Fam008955.a Fam013028.E.a Fam005457.C.b.b Fam013323.a.a Fam012668.d Fam008218.b.b Fam010193.b.b Fam008544.a.a Fam009193.a Fam005125.A.a.b.a.b Fam012943.f.b Click to hide this line (Lcha) Lcha terminal node Lcha - Chr:JH127149.1 abcb7 (ENSLACG00000002622) ZDHHC15 (ENSLACG00000006248) ATRX (ENSLACG00000010157) MAGT1 (ENSLACG00000011831) ENSLACG00000011999 ATP7A (ENSLACG00000012391) ENSLACG00000012864 pgk1 (ENSLACG00000012961) AMOT (ENSLACG00000013331) LHFPL1 (ENSLACG00000013958) TRPC5 (ENSLACG00000014880) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota duplication node (click to collapse) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Ggal) Ggal terminal node Ggal - Chr:4 ENSGALG00000007656 CDX4 (ENSGALG00000007657) ENSGALG00000007660 ENSGALG00000007683 ENSGALG00000007703 ENSGALG00000007710 ENSGALG00000007726 ENSGALG00000007740 SLC16A2 (ENSGALG00000007748) ENSGALG00000023655 RLIM (ENSGALG00000007750) NEXMIF (ENSGALG00000007755) UPRT (ENSGALG00000007793) ABCB7 (ENSGALG00000007788) ZDHHC15 (ENSGALG00000007800) ATRX (ENSGALG00000007843) MAGT1 (ENSGALG00000007861) COX7B (ENSGALG00000007863) ATP7A (ENSGALG00000007902) PGK1 (ENSGALG00000007936) AMOT (ENSGALG00000007952) TRPC5 (ENSGALG00000007972) ENSGALG00000007976 DCX (ENSGALG00000007993) CAPN6 (ENSGALG00000008006) PAK3 (ENSGALG00000008058) CHRDL1 (ENSGALG00000008072) AMMECR1 (ENSGALG00000008074) TMEM164 (ENSGALG00000008076) ACSL4 (ENSGALG00000008088) Click to hide this line (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) 28_Amniota - block_39 Fam013469 Fam008963.d.a Fam012008.b.b.b Fam012577.a.b Fam011821.b.a Fam012270.b.a.b.b Fam012270.b.a.b.a Fam009988.d.b Fam012684.a Fam010227.b.b Fam005135.E.a.a.b.b Fam007475.b.b Fam008019 Fam007495.a Fam008891.b.b Fam005714.A Fam006121.b.b Fam009569.a Fam007404.a.b.b Fam005675.B.a.a Fam013028.E.a.b Fam005457.C.b.b Fam013323.a.a Fam012668.d Fam008218.b.b Fam010193.b.b Fam008544.a.a Fam009193.b.a.a Fam005125.A.a.b.a.b Fam012943.f.b Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Psin) Psin terminal node Psin - Chr:JH212625.1 ENSPSIG00000008700 ENSPSIG00000009496 CDX4 (ENSPSIG00000010294) CHIC1 (ENSPSIG00000010306) ENSPSIG00000010462 ENSPSIG00000011558 ENSPSIG00000013635 ENSPSIG00000013879 ENSPSIG00000014574 SLC16A2 (ENSPSIG00000014662) RLIM (ENSPSIG00000014679) NEXMIF (ENSPSIG00000014863) ABCB7 (ENSPSIG00000014894) UPRT (ENSPSIG00000016494) ZDHHC15 (ENSPSIG00000016634) ATRX (ENSPSIG00000017559) MAGT1 (ENSPSIG00000008322) ENSPSIG00000008964 ATP7A (ENSPSIG00000008981) ENSPSIG00000009133 AMOT (ENSPSIG00000010084) LHFPL1 (ENSPSIG00000000351) ENSPSIG00000000355 TRPC5 (ENSPSIG00000010468) ALG13 (ENSPSIG00000011677) DCX (ENSPSIG00000012148) CAPN6 (ENSPSIG00000012395) PAK3 (ENSPSIG00000013160) CHRDL1 (ENSPSIG00000015962) AMMECR1 (ENSPSIG00000016725) Click to hide this line (27_Euarchontoglires) 27_Euarchontoglires speciation node (click to collapse) 27_Euarchontoglires - block_18 Fam005799 Fam006202.A.b Fam012128 Fam007496.a.b.a Fam008639 Fam015044.b.a.b Fam001221.a.a.b Fam012270.b.a.b.a Fam009988.d.b Fam011961.A.b Fam008019 Fam007495.a Fam008891.b.b Fam009707.a Fam005714.A Fam006121.b.b Fam009569.a Fam007404.a.a.a Fam010991.b.b.b Fam011983.b.a Fam012870.a.b.b.b Fam011392.a.b Fam012936.B.b.b.b.a.b Fam011471.a.b Fam010044.B.b.a.b.b.a.b.b Fam011349.a.a.b.b Fam007265.a.b Fam005381.I Fam005436.PB.b.b.b Click to hide this line (Hsap) Hsap terminal node Hsap - Chr:X PABPC1L2A (ENSG00000186288) ENSG00000204118 NAP1L2 (ENSG00000186462) CDX4 (ENSG00000131264) CHIC1 (ENSG00000204116) ZCCHC13 (ENSG00000187969) SLC16A2 (ENSG00000147100) RLIM (ENSG00000131263) NEXMIF (ENSG00000050030) ABCB7 (ENSG00000131269) UPRT (ENSG00000094841) ZDHHC15 (ENSG00000102383) MAGEE2 (ENSG00000186675) PBDC1 (ENSG00000102390) MAGEE1 (ENSG00000198934) ATRX (ENSG00000085224) MAGT1 (ENSG00000102158) COX7B (ENSG00000131174) ATP7A (ENSG00000165240) PGAM4 (ENSG00000226784) PGK1 (ENSG00000102144) TAF9B (ENSG00000187325) CYSLTR1 (ENSG00000173198) RTL3 (ENSG00000179300) LPAR4 (ENSG00000147145) P2RY10 (ENSG00000078589) GPR174 (ENSG00000147138) ITM2A (ENSG00000078596) TBX22 (ENSG00000122145) TENT5D (ENSG00000174016) Click to hide this line (Mmus) Mmus terminal node Mmus - Chr:X Cdx4 (ENSMUSG00000031326) Chic1 (ENSMUSG00000031327) Tsx (ENSMUSG00000031329) Gm26992 (ENSMUSG00000098078) Zcchc13 (ENSMUSG00000031330) Slc16a2 (ENSMUSG00000033965) Rlim (ENSMUSG00000056537) Nexmif (ENSMUSG00000046449) Abcb7 (ENSMUSG00000031333) Uprt (ENSMUSG00000073016) Zdhhc15 (ENSMUSG00000033906) Magee2 (ENSMUSG00000031224) Pbdc1 (ENSMUSG00000031226) Magee1 (ENSMUSG00000031227) Cypt2 (ENSMUSG00000090132) Atrx (ENSMUSG00000031229) Magt1 (ENSMUSG00000031232) Cox7b (ENSMUSG00000031231) Atp7a (ENSMUSG00000033792) Tlr13 (ENSMUSG00000033777) Pgk1 (ENSMUSG00000062070) Taf9b (ENSMUSG00000047242) Fnd3c2 (ENSMUSG00000073012) Fndc3c1 (ENSMUSG00000033737) Cysltr1 (ENSMUSG00000052821) Gm5127 (ENSMUSG00000073010) Rtl3 (ENSMUSG00000047686) Lpar4 (ENSMUSG00000049929) P2ry10 (ENSMUSG00000050921) P2ry10b (ENSMUSG00000054293) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Cmil) Cmil terminal node Cmil - scaffold_25 KIAA1211 (SINCAMG00000012286) AASDH (SINCAMG00000012294) ppat (SINCAMG00000012317) paics (SINCAMG00000012322) LONRF1 (SINCAMG00000012334) KIAA1456 (SINCAMG00000012372) DLC1 (SINCAMG00000012374) NULL (SINCAMG00000018425) DLC1 (SINCAMG00000012395) U1 (SINCAMG00000018069) NULL (SINCAMG00000018426) SGCZ (SINCAMG00000012399) U1 (SINCAMG00000017786) TUSC3 (SINCAMG00000012407) NULL (SINCAMG00000012414) ZDHHC2 (SINCAMG00000012432) CNOT7 (SINCAMG00000012441) VPS37A (SINCAMG00000012451) MTMR7 (SINCAMG00000012469) SLC7A2 (SINCAMG00000012508) PDGFRL (SINCAMG00000012538) Mtus1 (SINCAMG00000012543) FGL1 (SINCAMG00000012572) PCM1 (SINCAMG00000012576) GTF2E1 (SINCAMG00000012712) ASAH1 (SINCAMG00000012716) FRG1 (SINCAMG00000012758) C5orf15 (SINCAMG00000017013) FAT1 (SINCAMG00000012778) Click to show this node (35_Branchiostoma) 35_Branchiostoma speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Bbel) Bbel terminal node Bbel - Chr:NW_017804575.1 Bbel.109487778 Bbel.109487904 Bbel.109487559 Bbel.109487799 Bbel.109487795 Bbel.109487796 Bbel.109487797 Bbel.109487805 Bbel.109487560 Bbel.109487562 Bbel.109487563 Bbel.109487564 Bbel.109487565 Bbel.109487801 Bbel.109487802 Bbel.109487566 Bbel.109487804 Bbel.109487791 Bbel.109487790 Bbel.109487792 Bbel.109487794 Bbel.109487567 Trnav-cac (Bbel.109487906) Trnaa-ugc (Bbel.109487909) Trnaa-ugc (Bbel.109487910) Trnaa-ugc (Bbel.109487911) Bbel.109487879 Click to show this node (36_Chordata) 36_Chordata duplication node (click to collapse) Click to show this node (36_Chordata) 36_Chordata speciation node (click to collapse) Click to show this node (32_Olfactores) 32_Olfactores duplication node (click to collapse) Click to show this node (32_Olfactores) 32_Olfactores speciation node (click to collapse) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Cmil) Cmil terminal node Cmil - scaffold_110 N6AMT1 (SINCAMG00000003848) URB1 (SINCAMG00000003856) MRAP2 (SINCAMG00000003881) MIS18A (SINCAMG00000003885) ABCG1 (SINCAMG00000003890) TMPRSS2 (SINCAMG00000003911) ADAMTS5 (SINCAMG00000003928) ADAMTS1 (SINCAMG00000003949) CYYR1 (SINCAMG00000003957) APP (SINCAMG00000003963) Rsph1 (SINCAMG00000004061) WDR4 (SINCAMG00000004077) PDE9A (SINCAMG00000004088) SLC37A1 (SINCAMG00000004123) RRP1B (SINCAMG00000004151) PDXK (SINCAMG00000004168) AGPAT3 (SINCAMG00000004172) TRAPPC10 (SINCAMG00000004195) PWP2 (SINCAMG00000004203) GBE1 (SINCAMG00000004217) CADM2 (SINCAMG00000004229) C21orf33 (SINCAMG00000004244) ROBO1 (SINCAMG00000004246) ROBO2 (SINCAMG00000004266) PARD3 (SINCAMG00000004286) NULL (SINCAMG00000018158) Click to hide this line (32_Olfactores) 32_Olfactores speciation node (click to collapse) 32_Olfactores Click to show this node (20_Ascidiacea) 20_Ascidiacea duplication node (click to collapse) Click to show this node (20_Ascidiacea) 20_Ascidiacea speciation node (click to collapse) Click to show this node (12_Stolidobranchia) 12_Stolidobranchia speciation node (click to collapse) Click to show this node (11_Molgula) 11_Molgula speciation node (click to collapse) Click to show this node (9) 9 speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Moocul) Moocul terminal node Moocul - Chr:S27543 Moocul.g00001254,ZNF318 (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01254) Moocul.g00001255,SLC39A7,SLC39A9 (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01255) Moocul.g00001256,RAB1A,RAB1B,RAB8B (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01256) Moocul.g00001257 (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01257) Moocul.g00001258,HSPBAP1,JMJD7,KDM8 (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01258) Moocul.g00001259,ABCB10,AOX1,XDH (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01259) Moocul.g00001260 (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01260) Moocul.g00001261,THADA (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01261) Moocul.g00001262,C6orf120 (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01262) Moocul.g00001263,LGMN,PIGK (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01263) Moocul.g00001264,KIF3A,KIF6,KIF9 (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01264) Moocul.g00001265,AC027796.3,GANAB,GANC (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01265) Moocul.g00001267,GAA,GANAB,GANC (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01267) Moocul.g00001268,DAAM1,DAAM2,DIAPH1 (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01268) Click to hide this line (20_Ascidiacea) 20_Ascidiacea speciation node (click to collapse) 20_Ascidiacea Click to show this node (19_Phlebobranchia) 19_Phlebobranchia speciation node (click to collapse) Click to show this node (15_Ciona) 15_Ciona speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Cirobu) Cirobu terminal node Cirobu - Chr:KhS615 Cirobu.g00014818,ESS2 (KH.S615.5) Cirobu.g00014817,AC027796.3,GK2,SHPK (KH.S615.4) Cirobu.g00014819,AC027796.3,SHPK (KH.S615.6) Cirobu.g00014815,CALM1,CALM3,CALML3 (KH.S615.2) Cirobu.g00014821,CCDC175 (KH.S615.8) Cirobu.g00014820 (KH.S615.7) Click to show this node (12_Stolidobranchia) 12_Stolidobranchia speciation node (click to collapse) Click to show this node (6) 6 speciation node (click to collapse) Click to hide this line (2_Styelidae) 2_Styelidae speciation node (click to collapse) 2_Styelidae Click to hide this line (Boleac) Boleac terminal node Boleac - Chr:S479 Boleac.g00010405,CCDC33 (Boleac.CG.SB_v3.S479.g10405) Boleac.g00010406 (Boleac.CG.SB_v3.S479.g10406) Boleac.g00010407,FRMD1,FRMD6,PTPN13 (Boleac.CG.SB_v3.S479.g10407) Boleac.g00010409,EPHX2,EPHX3,MEST (Boleac.CG.SB_v3.S479.g10409) Boleac.g00010410,SLC39A12,SLC39A14,SLC39A4 (Boleac.CG.SB_v3.S479.g10410) Click to hide this line (Boschl) Boschl terminal node Boschl - Chr:chr9 Boschl.g00068829 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g68829) Boschl.g00066420 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g66420) Boschl.g00066421,ZW10 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g66421) Boschl.g00068897,ITAD,ITAM,ITAX (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g68897) Boschl.g00068946 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g68946) Boschl.g00066435 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g66435) Boschl.g00066436 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g66436) Boschl.g00068999,CCNI,CCNI2 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g68999) Boschl.g00069028,NOP2,NSUN5,NSUN6 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g69028) Boschl.g00069029 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g69029) Boschl.g00069043 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g69043) Boschl.g00069108,KLH11,KLH20,KLHL6 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g69108) Boschl.g00069109,KBTBC,KLH12,KLHL2 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g69109) Boschl.g00069146 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g69146) Boschl.g00069148,CASP3,CASP7,CASP8 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g69148) Boschl.g00066152 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g66152) Boschl.g00066130,196000194 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g66130) Boschl.g00066131,291235273 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g66131) Boschl.g00064273 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64273) Boschl.g00064319,ATPB,VATB1,VATB2 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64319) Boschl.g00064426 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64426) Boschl.g00064430,F200A,SCND3,ZBED5 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64430) Boschl.g00064431 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64431) Boschl.g00064703,MLL (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64703) Boschl.g00064704,KMT2A (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64704) Boschl.g00064822,THS7A,THS7B (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64822) Boschl.g00064844,SV421,SV422 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64844) Boschl.g00064865 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64865) Boschl.g00064866,PDIA4,PDIA5,PDIA6 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64866) Boschl.g00064874,LFG1,LFG2,LFG4 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g64874) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata duplication node (click to collapse) Click to hide this line (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) 31_Gnathostomata - block_133 Fam005736.D.b.b Fam005049.A.e Fam012057.A.a.b Fam011429.b.a Fam010908.A.a Fam005383.U.a Fam007838.D.a.b.b Fam009502 Fam012959.a Fam007748.a.a Click to hide this line (Cmil) Cmil terminal node Cmil - scaffold_50 AFF1 (SINCAMG00000014470) SLC10A6 (SINCAMG00000014569) TMEM144 (SINCAMG00000014588) PTPN13 (SINCAMG00000014614) MAPK10 (SINCAMG00000014700) ARHGAP24 (SINCAMG00000014753) AFMID (SINCAMG00000014818) WDFY3 (SINCAMG00000014831) CDS1 (SINCAMG00000014901) tmem175 (SINCAMG00000014906) NULL (SINCAMG00000018609) RASGEF1B (SINCAMG00000014914) PRKG2 (SINCAMG00000014921) bmp3 (SINCAMG00000014990) C4orf22 (SINCAMG00000014994) prdm8b (SINCAMG00000015011) Antxr1 (SINCAMG00000015015) Paqr3 (SINCAMG00000015047) BMP2K (SINCAMG00000015058) ANXA3 (SINCAMG00000015090) FRAS1 (SINCAMG00000015101) SLC7A11 (SINCAMG00000015174) MRPL1 (SINCAMG00000015179) CNOT6L (SINCAMG00000015191) IL8 (SINCAMG00000015216) gar1 (SINCAMG00000015220) RRH (SINCAMG00000015245) LRIT3 (SINCAMG00000015250) EGF (SINCAMG00000015254) ELOVL6 (SINCAMG00000015282) Click to hide this line (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) 29_Sarcopterygii - block_190 Fam005736.D.b.b Fam005049.A.e Fam012057.A.a.b Fam011429.b.a Fam010908.A.a.b Fam005383.U.a Fam007838.D.a.b.b Fam009502 Fam012959.a Fam007748.a.a Click to hide this line (Lcha) Lcha terminal node Lcha - Chr:JH127110.1 BMP3 (ENSLACG00000001975) ENSLACG00000009667 ENSLACG00000012556 Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota duplication node (click to collapse) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota duplication node (click to collapse) Click to hide this line (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) 28_Amniota - block_114 Fam008688 Fam010120.a.d.b Fam011776 Fam013044 Fam006298.d.a.a Fam011731.b Fam002354.b.b.b Fam007748.a.a Fam012959.b Fam009502 Fam007838.D.a.b.b Fam005383.U.a Fam010908.A.a.b.b Fam010908.A.a.b.a Fam011429.b.a Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Ggal) Ggal terminal node Ggal - Chr:4 SPATA4 (ENSGALG00000010822) ASB5 (ENSGALG00000010837) SPCS3 (ENSGALG00000010839) VEGFC (ENSGALG00000010847) MTHFD2L (ENSGALG00000010855) EPGN (ENSGALG00000010859) EREG (ENSGALG00000010864) AREG (ENSGALG00000010866) USO1 (ENSGALG00000010878) G3BP2 (ENSGALG00000010882) ENSGALG00000010883 BMP2K (ENSGALG00000010885) PAQR3 (ENSGALG00000010886) ENSGALG00000010892 ENSGALG00000026560 ENSGALG00000010898 ENSGALG00000010903 PRKG2 (ENSGALG00000010909) PKD2 (ENSGALG00000010921) SPP1 (ENSGALG00000010926) DMP1 (ENSGALG00000010927) IBSP (ENSGALG00000010928) ENSGALG00000020195 SPARCL1 (ENSGALG00000010929) NUDT9 (ENSGALG00000010932) ENSGALG00000010963 HSD17B11 (ENSGALG00000010979) ENSGALG00000020194 KLHL8 (ENSGALG00000011017) ENSGALG00000011045 Click to show this node (27_Euarchontoglires) 27_Euarchontoglires speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Mmus) Mmus terminal node Mmus - Chr:5 Gm7971 (ENSMUSG00000094043) Gm7978 (ENSMUSG00000096139) Gm7982 (ENSMUSG00000072814) E330014E10Rik (ENSMUSG00000072813) Cxcl13 (ENSMUSG00000023078) Cnot6l (ENSMUSG00000034724) Mrpl1 (ENSMUSG00000029486) Fras1 (ENSMUSG00000034687) Anxa3 (ENSMUSG00000029484) Bmp2k (ENSMUSG00000034663) Paqr3 (ENSMUSG00000055725) Naa11 (ENSMUSG00000046000) Gk2 (ENSMUSG00000050553) Antxr2 (ENSMUSG00000029338) Prdm8 (ENSMUSG00000035456) Cfap299 (ENSMUSG00000057816) Gm11111 (ENSMUSG00000079416) Bmp3 (ENSMUSG00000029335) Prkg2 (ENSMUSG00000029334) ENSMUSG00000109804 ENSMUSG00000029333 Rasgef1b (ENSMUSG00000089809) Hnrnpd (ENSMUSG00000000568) 4930524J08Rik (ENSMUSG00000035364) Hnrnpdl (ENSMUSG00000029328) Enoph1 (ENSMUSG00000029326) Tmem150c (ENSMUSG00000050640) Sec31a (ENSMUSG00000035325) Lin54 (ENSMUSG00000035310) Cops4 (ENSMUSG00000035297) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) Click to show this node (27_Euarchontoglires) 27_Euarchontoglires speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Hsap) Hsap terminal node Hsap - Chr:4 SOWAHB (ENSG00000186212) SEPT11 (ENSG00000138758) CCNI (ENSG00000118816) CCNG2 (ENSG00000138764) CXCL13 (ENSG00000156234) CNOT6L (ENSG00000138767) MRPL1 (ENSG00000169288) FRAS1 (ENSG00000138759) ANXA3 (ENSG00000138772) BMP2K (ENSG00000138756) PAQR3 (ENSG00000163291) NAA11 (ENSG00000156269) GK2 (ENSG00000196475) ANTXR2 (ENSG00000163297) PRDM8 (ENSG00000152784) CFAP299 (ENSG00000197826) BMP3 (ENSG00000152785) PRKG2 (ENSG00000138669) RASGEF1B (ENSG00000138670) HNRNPD (ENSG00000138668) HNRNPDL (ENSG00000152795) ENOPH1 (ENSG00000145293) TMEM150C (ENSG00000249242) SCD5 (ENSG00000145284) SEC31A (ENSG00000138674) THAP9 (ENSG00000168152) LIN54 (ENSG00000189308) COPS4 (ENSG00000138663) PLAC8 (ENSG00000145287) COQ2 (ENSG00000173085) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Psin) Psin terminal node Psin - Chr:JH205198.1 ENSPSIG00000016552 COQ2 (ENSPSIG00000016561) ENSPSIG00000016565 ENSPSIG00000016570 ENSPSIG00000016575 COPS4 (ENSPSIG00000016589) LIN54 (ENSPSIG00000016595) THAP9 (ENSPSIG00000016699) SEC31A (ENSPSIG00000016702) SCD5 (ENSPSIG00000016708) HNRNPDL (ENSPSIG00000016746) HNRNPD (ENSPSIG00000017029) ENSPSIG00000017550 RASGEF1B (ENSPSIG00000017554) BMP3 (ENSPSIG00000017711) PRDM8 (ENSPSIG00000017779) ANTXR2 (ENSPSIG00000017787) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata duplication node (click to collapse) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Cmil) Cmil terminal node Cmil - scaffold_70 BYSL (SINCAMG00000009142) MED20 (SINCAMG00000009143) USP49 (SINCAMG00000009144) TOMM6 (SINCAMG00000009145) HARBI1 (SINCAMG00000009146) Pphln1 (SINCAMG00000009147) PRICKLE2 (SINCAMG00000009149) FRS2 (SINCAMG00000009152) RAB7B (SINCAMG00000009155) SLC26A9 (SINCAMG00000009156) SPAM1 (SINCAMG00000009158) PM20D1 (SINCAMG00000009161) Rab7l1 (SINCAMG00000009169) NUCKS1 (SINCAMG00000009171) SLC45A3 (SINCAMG00000009175) Chia (SINCAMG00000009177) CHIA (SINCAMG00000009182) CPSF6 (SINCAMG00000009183) C1orf88 (SINCAMG00000009185) SORT1 (SINCAMG00000009187) psma5 (SINCAMG00000009191) RASSF5 (SINCAMG00000009195) TBC1D30 (SINCAMG00000009197) EIF2D (SINCAMG00000009199) DYRK3 (SINCAMG00000009202) MAPKAPK2 (SINCAMG00000009204) IL10 (SINCAMG00000009206) IL24 (SINCAMG00000009207) IL24 (SINCAMG00000009208) ATP5F1 (SINCAMG00000009210) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata duplication node (click to collapse) Click to hide this line (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) 31_Gnathostomata - block_32 Fam008592.b.b.a.a Fam011454 Fam009944 Fam012401.a.a Fam009387 Fam011169.a.b Fam008274.b.a.a.a.b Fam008274.b.a.b.a.b Fam009543.b.b.b.a.b Fam013235.b Fam005149.D.b.a Fam005135.F.b Fam005492.B.a Fam010676.a Fam006782.a Fam007022.a.b Fam010551.b.a.b Click to hide this line (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) 29_Sarcopterygii - block_46 Fam005149.D.b.a Fam013235.b Fam009543.b.b.b.a.b Fam008274.b.a.b.a.b Fam008274.b.a.a.a.b.b Fam011169.a.b Fam009387 Fam012401.a.a Fam009944 Fam012812.a.b.b.b.a Fam011454 Fam008592.b.b.a.a Fam013140.a.b.b.b.b.a Fam005454.K.a.b Fam007599.b.b Fam009829.a.b.a Fam005149.B.a.a Fam005402.B.a.a.b.b.b Fam011996 Fam004754.D.a.b.b Fam009905.a Fam011872.B.a.b.b Fam011705.b.b.a Fam009892.b Click to hide this line (Lcha) Lcha terminal node Lcha - Chr:JH126600.1 ENSLACG00000006473 zgc:153031 (ENSLACG00000007419) CRY1 (ENSLACG00000008174) ENSLACG00000009924 BTBD11 (ENSLACG00000012005) PWP1 (ENSLACG00000013058) si:ch211-219a15.3 (ENSLACG00000013245) TSPAN9 (ENSLACG00000013904) TSPAN11 (ENSLACG00000015678) PRMT8 (ENSLACG00000016345) ENSLACG00000016518 PARP11 (ENSLACG00000016902) ccnd2b (ENSLACG00000017913) TIGAR (ENSLACG00000017982) FGF23 (ENSLACG00000018023) zgc:77158 (ENSLACG00000018057) C12orf4 (ENSLACG00000018127) RAD51AP1 (ENSLACG00000018171) dyrk4 (ENSLACG00000018269) NDUFA9 (ENSLACG00000018314) ENSLACG00000018366 ENSLACG00000018380 KCNA1 (ENSLACG00000018438) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota duplication node (click to collapse) Click to hide this line (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) 28_Amniota - block_102 Fam005149.D.b.a Fam013235.b Fam009543.b.b.b.a.b Fam008274.b.a.b.a.b Fam008274.b.a.a.a.b.b Fam012401.a.a.a Fam009944 Fam012812.a.b.b.b.a Fam011454.a Fam013140.a.b.b.b.b.a Fam005454.K.a.b.b Fam007599.b.b.b Fam009829.a.b.b Fam005149.B.a.a Fam006350.d.b.b Fam008597.b.a Fam011565.b Fam009771.A.a Fam012699.A.f.c Fam012699.A.f.d Click to hide this line (27_Euarchontoglires) 27_Euarchontoglires speciation node (click to collapse) 27_Euarchontoglires - block_65 Fam010657 Fam007424.c Fam009100.a.b.b.a Fam013425.b.a Fam012364.A.c.a Fam005149.D.b.a Fam013235.b Fam009543.b.b.b.a.b Fam008274.b.a.b.a.b Fam008274.b.a.a.a.b.a Fam008274.b.a.b.b Fam011169.a.a Fam009387 Fam012401.a.a.b Fam009944 Fam012812.a.b.b.b.a Fam011454.b Fam008592.b.b.a.b Fam013140.a.b.b.b.b.a Fam005454.K.a.b.b Fam007599.b.b.b Fam009829.a.b.b Fam005149.B.a.a Fam006350.d.b.b Fam008597.b.a Fam011565.b Fam009771.A.a Fam012699.A.f.c.e Fam012699.A.f.d Click to hide this line (Hsap) Hsap terminal node Hsap - Chr:12 FKBP4 (ENSG00000004478) ITFG2 (ENSG00000111203) NRIP2 (ENSG00000053702) 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ENSPSIG00000009488 ENSPSIG00000009781 RAD51AP1 (ENSPSIG00000010393) C12orf4 (ENSPSIG00000010408) FGF23 (ENSPSIG00000011460) ENSPSIG00000011594 ENSPSIG00000011596 AKAP3 (ENSPSIG00000011615) NDUFA9 (ENSPSIG00000011789) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Ggal) Ggal terminal node Ggal - Chr:1 ENSGALG00000014147 ENSGALG00000013461 ENSGALG00000028155 ENSGALG00000014141 ENSGALG00000028812 ENSGALG00000028286 ENSGALG00000026896 CDKN1B (ENSGALG00000022980) ENSGALG00000028453 ENSGALG00000026372 KLHL42 (ENSGALG00000017296) PTHLH (ENSGALG00000017295) FAR2 (ENSGALG00000017291) RAD51AP1 (ENSGALG00000017290) C12orf4 (ENSGALG00000017289) FGF23 (ENSGALG00000027791) TIGAR (ENSGALG00000026776) CCND2 (ENSGALG00000017283) NDUFA9 (ENSGALG00000017282) KCNA1 (ENSGALG00000017280) ENSGALG00000025798 ENSGALG00000017279 NTF3 (ENSGALG00000027299) 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node (click to collapse) Click to hide this line (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) 28_Amniota - block_38 Fam012586.a.a.b Fam008765.a Fam009120.b.b Fam005422.F.b Fam009543.b.b.b.b Fam012812.a.b.b.b.b.b.a Fam008592.b.a.a Fam010603.b Fam007107.a Fam005997.b Fam008386.a Fam005159.G.a.b Fam003031.b.b Fam012316.c.b Fam005144.A.b.a Fam009481 Fam009950.L Fam009543.b.a.a Fam008807.b.b.a.b Fam010204.a Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Ggal) Ggal terminal node Ggal - Chr:5 TIMM10 (ENSGALG00000004845) ENSGALG00000023441 SLC43A3 (ENSGALG00000020479) ENSGALG00000007420 ENSGALG00000007501 SSRP1 (ENSGALG00000007520) ENSGALG00000027524 APLNR (ENSGALG00000004841) LRRC55 (ENSGALG00000029130) ENSGALG00000007525 INCENP (ENSGALG00000007537) TPCN2 (ENSGALG00000007550) CCND1 (ENSGALG00000007555) LTO1 (ENSGALG00000007556) FGF19 (ENSGALG00000028376) ENSGALG00000007566 ENSGALG00000007617 FADD 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(31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) 31_Gnathostomata Click to hide this line (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) 29_Sarcopterygii - block_775 Fam012812.a.b.b.b.b.b Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Psin) Psin terminal node Psin - Chr:JH205398.1 FGF19 (ENSPSIG00000009409) LTO1 (ENSPSIG00000009754) CCND1 (ENSPSIG00000010300) TPCN2 (ENSPSIG00000012409) NADSYN1 (ENSPSIG00000013537) DHCR7 (ENSPSIG00000016888) ZDHHC13 (ENSPSIG00000005720) CSRP3 (ENSPSIG00000008192) E2F8 (ENSPSIG00000008707) NAV2 (ENSPSIG00000009374) DBX1 (ENSPSIG00000012138) PRMT3 (ENSPSIG00000012339) SLC6A5 (ENSPSIG00000012480) NELL1 (ENSPSIG00000014262) ANO5 (ENSPSIG00000015336) Click to hide this line (Lcha) Lcha terminal node Lcha - Chr:JH126862.1 SHANK2 (ENSLACG00000004766) CTTN (ENSLACG00000006679) PPFIA1 (ENSLACG00000007439) FADD (ENSLACG00000008763) ANO1 (ENSLACG00000009098) zgc:153993 (ENSLACG00000011168) FGF19 (ENSLACG00000012846) lto1 (ENSLACG00000012966) CCND1 (ENSLACG00000013180) TPCN2 (ENSLACG00000015494) NADSYN1 (ENSLACG00000015568) DHCR7 (ENSLACG00000015729) ENSLACG00000015905 ZDHHC13 (ENSLACG00000015963) CSRP3 (ENSLACG00000016057) E2F8 (ENSLACG00000016113) Click to hide this line (Cmil) Cmil terminal node Cmil - scaffold_8 DBX1 (SINCAMG00000007844) NAV2 (SINCAMG00000007845) E2F8 (SINCAMG00000007894) CSRP3 (SINCAMG00000007905) ZDHHC13 (SINCAMG00000007910) LDHB (SINCAMG00000007937) ZNF91 (SINCAMG00000007938) DHCR7 (SINCAMG00000007957) NADSYN1 (SINCAMG00000007971) tpcn2 (SINCAMG00000007988) NULL (SINCAMG00000018775) NULL (SINCAMG00000018776) CCND1 (SINCAMG00000008007) ORAOV1 (SINCAMG00000008010) BAX (SINCAMG00000008025) ANO1 (SINCAMG00000008029) FADD (SINCAMG00000008050) PPFIA1 (SINCAMG00000008053) CTTN (SINCAMG00000008106) SHANK2 (SINCAMG00000008139) GOLGB1 (SINCAMG00000008150) GUCA1B (SINCAMG00000008169) C12orf23 (SINCAMG00000008172) CHST1 (SINCAMG00000008173) SLC35C1 (SINCAMG00000008176) CRY2 (SINCAMG00000008182) CSTF3 (SINCAMG00000008187) TCP11L1 (SINCAMG00000008220) DEPDC7 (SINCAMG00000008230) Click to hide this line (36_Chordata) 36_Chordata speciation node (click to collapse) 36_Chordata Click to hide this line (35_Branchiostoma) 35_Branchiostoma speciation node (click to collapse) 35_Branchiostoma - block_210 Fam005279.D.b Fam012891.b Fam010258.b Fam010553 Fam012150.E Fam012153.I Fam012293 Fam005697.A.b Fam005206.A Fam012890 Click to hide this line (Blan) Blan terminal node Blan - Chr:Sc0000057 BL19529 BL00086 BL43196 BL16744 BL23220 BL00965 BL16738 BL43190 BL80631 BL68157 BL04621 BL27996 BL26759 BL80630 BL80633 BL90078 BL95544 BL95545 BL84107 BL95543 BL00963 BL18467 BL18464 BL10222 BL90076 BL90075 BL18472 BL90074 BL90073 BL23222 Click to hide this line (Bbel) Bbel terminal node Bbel - Chr:NW_017804165.1 Bbel.109480916 Bbel.109480915 Bbel.109480917 Bbel.109480908 Bbel.109480879 Bbel.109481026 Bbel.109480905 Bbel.109480906 Bbel.109480885 Bbel.109480888 Bbel.109480890 Bbel.109480889 Bbel.109480892 Bbel.109480893 Bbel.109480894 Bbel.109480896 Bbel.109480922 Bbel.109480904 Bbel.109480902 Bbel.109480909 Bbel.109480911 Bbel.109480880 Bbel.109480881 Bbel.109480882 Bbel.109480918 Bbel.109480898 Bbel.109480884 Bbel.109480897 Click to show this node (32_Olfactores) 32_Olfactores speciation node (click to collapse) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata duplication node (click to collapse) Click to hide this line (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) 31_Gnathostomata Click to hide this line (Cmil) Cmil terminal node Cmil - scaffold_8 HTATIP2 (SINCAMG00000007838) DBX1 (SINCAMG00000007844) NAV2 (SINCAMG00000007845) E2F8 (SINCAMG00000007894) CSRP3 (SINCAMG00000007905) ZDHHC13 (SINCAMG00000007910) LDHB (SINCAMG00000007937) ZNF91 (SINCAMG00000007938) DHCR7 (SINCAMG00000007957) NADSYN1 (SINCAMG00000007971) tpcn2 (SINCAMG00000007988) NULL (SINCAMG00000018775) NULL (SINCAMG00000018776) CCND1 (SINCAMG00000008007) ORAOV1 (SINCAMG00000008010) BAX (SINCAMG00000008025) ANO1 (SINCAMG00000008029) FADD (SINCAMG00000008050) PPFIA1 (SINCAMG00000008053) CTTN (SINCAMG00000008106) SHANK2 (SINCAMG00000008139) GOLGB1 (SINCAMG00000008150) GUCA1B (SINCAMG00000008169) C12orf23 (SINCAMG00000008172) CHST1 (SINCAMG00000008173) SLC35C1 (SINCAMG00000008176) CRY2 (SINCAMG00000008182) CSTF3 (SINCAMG00000008187) TCP11L1 (SINCAMG00000008220) Click to hide this line (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) 29_Sarcopterygii - block_775 Fam012812.a.b.b.b.b.b Click to hide this line (Lcha) Lcha terminal node Lcha - Chr:JH126862.1 SHANK2 (ENSLACG00000004766) CTTN (ENSLACG00000006679) PPFIA1 (ENSLACG00000007439) FADD (ENSLACG00000008763) ANO1 (ENSLACG00000009098) zgc:153993 (ENSLACG00000011168) FGF19 (ENSLACG00000012846) lto1 (ENSLACG00000012966) CCND1 (ENSLACG00000013180) TPCN2 (ENSLACG00000015494) NADSYN1 (ENSLACG00000015568) DHCR7 (ENSLACG00000015729) ENSLACG00000015905 ZDHHC13 (ENSLACG00000015963) CSRP3 (ENSLACG00000016057) E2F8 (ENSLACG00000016113) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota duplication node (click to collapse) Click to show this node (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Psin) Psin terminal node Psin - Chr:JH205398.1 FGF19 (ENSPSIG00000009409) LTO1 (ENSPSIG00000009754) CCND1 (ENSPSIG00000010300) TPCN2 (ENSPSIG00000012409) NADSYN1 (ENSPSIG00000013537) DHCR7 (ENSPSIG00000016888) ZDHHC13 (ENSPSIG00000005720) CSRP3 (ENSPSIG00000008192) E2F8 (ENSPSIG00000008707) NAV2 (ENSPSIG00000009374) DBX1 (ENSPSIG00000012138) PRMT3 (ENSPSIG00000012339) SLC6A5 (ENSPSIG00000012480) NELL1 (ENSPSIG00000014262) Click to hide this line (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) 28_Amniota - block_38 Fam012586.a.a.b Fam008765.a Fam009120.b.b Fam005422.F.b Fam009543.b.b.b.b Fam012812.a.b.b.b.b.b.a Fam008592.b.a.a Fam010603.b Fam007107.a Fam005997.b Fam008386.a Fam005159.G.a.b Fam003031.b.b Fam012316.c.b Fam005144.A.b.a Fam009481 Fam009950.L Fam009543.b.a.a Fam008807.b.b.a.b Click to hide this line (27_Euarchontoglires) 27_Euarchontoglires speciation node (click to collapse) 27_Euarchontoglires - block_116 Fam010603.b Fam008592.b.a.a Fam012282.b.a.a Fam012812.a.b.b.b.b.b.a Fam009543.b.b.b.b Fam005422.F.a Fam009120.b.b Fam008765.a Fam012586.a.a.b Fam005997.b Fam007107.a Click to hide this line (Mmus) Mmus terminal node Mmus - Chr:7 Cars (ENSMUSG00000010755) Tnfrsf26 (ENSMUSG00000045362) Tnfrsf22 (ENSMUSG00000010751) Tnfrsf23 (ENSMUSG00000037613) Osbpl5 (ENSMUSG00000037606) Mrgprg (ENSMUSG00000050276) Mrgpre (ENSMUSG00000048965) Nadsyn1 (ENSMUSG00000031090) Dhcr7 (ENSMUSG00000058454) Gm498 (ENSMUSG00000031085) Shank2 (ENSMUSG00000037541) Cttn (ENSMUSG00000031078) Ppfia1 (ENSMUSG00000037519) Fadd (ENSMUSG00000031077) Ano1 (ENSMUSG00000031075) Fgf15 (ENSMUSG00000031073) Oraov1 (ENSMUSG00000031072) Ccnd1 (ENSMUSG00000070348) Tpcn2 (ENSMUSG00000048677) Mrgprf (ENSMUSG00000031070) Mrgprd (ENSMUSG00000051207) Click to hide this line (Hsap) Hsap terminal node Hsap - Chr:11 PPP6R3 (ENSG00000110075) GAL (ENSG00000069482) TESMIN (ENSG00000132749) CPT1A (ENSG00000110090) MRPL21 (ENSG00000197345) IGHMBP2 (ENSG00000132740) MRGPRD (ENSG00000172938) MRGPRF (ENSG00000172935) TPCN2 (ENSG00000162341) MYEOV (ENSG00000172927) CCND1 (ENSG00000110092) LTO1 (ENSG00000149716) ENSG00000281781 FGF19 (ENSG00000162344) ANO1 (ENSG00000131620) FADD (ENSG00000168040) PPFIA1 (ENSG00000131626) CTTN (ENSG00000085733) SHANK2 (ENSG00000162105) DHCR7 (ENSG00000172893) NADSYN1 (ENSG00000172890) KRTAP5-7 (ENSG00000244411) KRTAP5-8 (ENSG00000241233) KRTAP5-9 (ENSG00000254997) KRTAP5-10 (ENSG00000204572) KRTAP5-11 (ENSG00000204571) FAM86C1 (ENSG00000158483) DEFB108B (ENSG00000184276) DEFB131B (ENSG00000225805) Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Ggal) Ggal terminal node Ggal - Chr:5 ENSGALG00000023441 SLC43A3 (ENSGALG00000020479) ENSGALG00000007420 ENSGALG00000007501 SSRP1 (ENSGALG00000007520) ENSGALG00000027524 APLNR (ENSGALG00000004841) LRRC55 (ENSGALG00000029130) ENSGALG00000007525 INCENP (ENSGALG00000007537) TPCN2 (ENSGALG00000007550) CCND1 (ENSGALG00000007555) LTO1 (ENSGALG00000007556) FGF19 (ENSGALG00000028376) ENSGALG00000007566 ENSGALG00000007617 FADD (ENSGALG00000007625) ENSGALG00000007672 CTTN (ENSGALG00000007700) ENSGALG00000007719 ENSGALG00000014620 ENSGALG00000021487 ENSGALG00000006619 ENSGALG00000028582 CAPRIN1 (ENSGALG00000013532) NAT10 (ENSGALG00000014573) ENSGALG00000011609 ENSGALG00000014471 ENSGALG00000007811 Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata duplication node (click to collapse) Click to hide this line (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) 31_Gnathostomata - block_201 Fam008811.c.a.b Fam007718.a Fam009652 Fam008515.a Fam006884.a Fam012035 Fam009216.b.a Fam013059.b.b Click to hide this line (Cmil) Cmil terminal node Cmil - scaffold_5 LYSMD2 (SINCAMG00000006220) TMOD2 (SINCAMG00000006222) leo1 (SINCAMG00000006235) MAPK6 (SINCAMG00000006251) bcl2l10 (SINCAMG00000006260) GNB5 (SINCAMG00000006261) MYO5C (SINCAMG00000006265) MYO5A (SINCAMG00000006323) ARPP19 (SINCAMG00000006375) KIAA1370 (SINCAMG00000006379) WDR72 (SINCAMG00000006397) ATP8B2 (SINCAMG00000006405) NNT (SINCAMG00000006474) DTWD1 (SINCAMG00000006481) C15orf33 (SINCAMG00000006484) GALK2 (SINCAMG00000006492) COPS2 (SINCAMG00000006511) SECISBP2L (SINCAMG00000006533) RGS7BP (SINCAMG00000006562) SHC4 (SINCAMG00000006565) cep152 (SINCAMG00000006592) Gpr150 (SINCAMG00000006619) FAM81A (SINCAMG00000006621) MYO1E (SINCAMG00000006626) CCNB2 (SINCAMG00000006720) RNF111 (SINCAMG00000006725) SLTM (SINCAMG00000006740) FAM63B (SINCAMG00000006809) ADAM10 (SINCAMG00000006822) LIPC (SINCAMG00000006835) Click to hide this line (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) 29_Sarcopterygii - block_8 Fam008233.a Fam001886 Fam009433.d.a Fam005459.I.b.b Fam005296.R.b.b.b.b Fam011431.a Fam012838.b.b Fam005258.C.b Fam011606.b.b.b Fam009808.d.a Fam013059.b.b Fam009216.b.a Fam012035 Fam006884.a Fam008515.a Fam009652 Fam007718.a Fam008811.c.a.b Fam004876.H Fam005700.A.b.b Fam004847.H Fam011972.a.b.b Fam011972.a.a Fam008474.b Fam011711.b.b.a Fam011285.b.b Fam009546.a.a Fam012651.G Fam010281.b Fam005202.E.b Click to hide this line (Lcha) Lcha terminal node Lcha - Chr:JH127003.1 SEMA6D (ENSLACG00000004006) SLC24A5 (ENSLACG00000005990) MYEF2 (ENSLACG00000006382) SLC12A1 (ENSLACG00000007198) FBN1 (ENSLACG00000008937) CEP152 (ENSLACG00000011519) SHC4 (ENSLACG00000012121) SECISBP2L (ENSLACG00000012542) COPS2 (ENSLACG00000012934) GALK2 (ENSLACG00000013148) ENSLACG00000022514 DTWD1 (ENSLACG00000014657) nnt2 (ENSLACG00000014716) ATP8B4 (ENSLACG00000014996) SPATA5L1 (ENSLACG00000015448) C15orf48 (ENSLACG00000022129) SLC30A4 (ENSLACG00000015653) Click to hide this line (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) 28_Amniota - block_101 Fam004876.H Fam008811.c.a.b Fam007718.a Fam009652 Fam008515.a Fam006884.a.b.b Fam012035 Fam009216.b.a Fam013059.b.a Fam009837.a Fam007683.a.b.a.a.b Fam009808.d.a Fam011606.b.b.a Fam005258.C.b Fam012838.b.b Fam011431.a Fam005296.R.b.b.b.b Fam005459.I.b.a Fam009433.d.a.b Click to hide this line (27_Euarchontoglires) 27_Euarchontoglires speciation node (click to collapse) 27_Euarchontoglires - block_36 Fam005700.A.b.a Fam004847.H Fam011972.a.a Fam008474.b Fam012838.b.b Fam005258.C.b Fam011606.b.b.a Fam009808.d.a Fam007683.a.b.a.a.b Fam009837.a Fam013059.b.a Fam009216.b.a Fam012035 Fam006884.a.b.b Fam008515.a Fam009652 Fam008811.c.a.b Fam005073.B.a.a.a Fam005484.B Fam005202.E.b.b Fam010281.b Fam012651.G Fam009546.a.a Fam011285.b.b Fam001886 Click to hide this line (Hsap) Hsap terminal node Hsap - Chr:15 SQOR (ENSG00000137767) ENSG00000259752 SEMA6D (ENSG00000137872) SLC24A5 (ENSG00000188467) MYEF2 (ENSG00000104177) CTXN2 (ENSG00000233932) SLC12A1 (ENSG00000074803) DUT (ENSG00000128951) FBN1 (ENSG00000166147) CEP152 (ENSG00000103995) SHC4 (ENSG00000185634) EID1 (ENSG00000255302) SECISBP2L (ENSG00000138593) COPS2 (ENSG00000166200) GALK2 (ENSG00000156958) FAM227B (ENSG00000166262) DTWD1 (ENSG00000104047) ATP8B4 (ENSG00000104043) SLC27A2 (ENSG00000140284) HDC (ENSG00000140287) GABPB1 (ENSG00000104064) USP8 (ENSG00000138592) USP50 (ENSG00000170236) TRPM7 (ENSG00000092439) SPPL2A (ENSG00000138600) AP4E1 (ENSG00000081014) TNFAIP8L3 (ENSG00000183578) CYP19A1 (ENSG00000137869) GLDN (ENSG00000186417) DMXL2 (ENSG00000104093) Click to hide this line (Mmus) Mmus terminal node Mmus - Chr:2 Sema6d (ENSMUSG00000027200) Slc24a5 (ENSMUSG00000035183) Myef2 (ENSMUSG00000027201) Ctxn2 (ENSMUSG00000074872) Slc12a1 (ENSMUSG00000027202) Dut (ENSMUSG00000027203) Fbn1 (ENSMUSG00000027204) Gm9913 (ENSMUSG00000053615) Cep152 (ENSMUSG00000068394) Shc4 (ENSMUSG00000035109) Eid1 (ENSMUSG00000091337) Secisbp2l (ENSMUSG00000035093) Cops2 (ENSMUSG00000027206) Galk2 (ENSMUSG00000027207) Fam227b (ENSMUSG00000027209) Dtwd1 (ENSMUSG00000023330) Gm17555 (ENSMUSG00000090353) Atp8b4 (ENSMUSG00000060131) Slc27a2 (ENSMUSG00000027359) Hdc (ENSMUSG00000027360) Gabpb1 (ENSMUSG00000027361) Usp8 (ENSMUSG00000027363) Usp50 (ENSMUSG00000027364) Trpm7 (ENSMUSG00000027365) Sppl2a (ENSMUSG00000027366) Ap4e1 (ENSMUSG00000001998) Blvra (ENSMUSG00000001999) Ncaph (ENSMUSG00000034906) Itpripl1 (ENSMUSG00000074825) 1810024B03Rik (ENSMUSG00000044145) Click to hide this line (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) 24_Archelosauria - block_8 Fam005073.B.a.a.a Fam005484.B Fam005202.E.b.b Fam010281.b Fam012651.G Fam009546.a.a.b Fam011285.b.b Fam011711.b.b.a Fam008474.b Fam011972.a.b.b Fam004847.H Fam004876.H Fam008811.c.a.b Fam007718.a Fam009652 Fam008515.a Fam006884.a.b.b Fam012035 Fam009216.b.a Fam013059.b.a Fam009837.a Fam007683.a.b.a.a.b Fam009808.d.a Fam011606.b.b.a Fam005258.C.b Fam012838.b.b Fam011431.a Fam005296.R.b.b.b.b Fam005459.I.b.a Fam009433.d.a.b Click to hide this line (Psin) Psin terminal node Psin - Chr:JH212494.1 ENSPSIG00000007563 SPPL2A (ENSPSIG00000008469) ENSPSIG00000009040 ENSPSIG00000010261 BLOC1S6 (ENSPSIG00000011347) SLC30A4 (ENSPSIG00000011559) ENSPSIG00000012547 SPATA5L1 (ENSPSIG00000006702) ATP8B4 (ENSPSIG00000006738) ENSPSIG00000008100 DTWD1 (ENSPSIG00000008751) GALK2 (ENSPSIG00000009230) COPS2 (ENSPSIG00000010252) SECISBP2L (ENSPSIG00000011270) SHC4 (ENSPSIG00000011633) CEP152 (ENSPSIG00000011993) FBN1 (ENSPSIG00000013146) DUT (ENSPSIG00000015285) SLC12A1 (ENSPSIG00000015396) MYEF2 (ENSPSIG00000016637) SLC24A5 (ENSPSIG00000017429) SEMA6D (ENSPSIG00000017665) ENSPSIG00000000767 GLDN 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speciation node (click to collapse) 31_Gnathostomata - block_5 Fam008731.b Fam004832.J Fam012376.c.b Fam010215.b.e Fam003975.a.b.a.a.a Fam010706 Fam009178.a.b Fam004824.H.a Fam012502.a.c.b Fam007745.d.b Fam005727.B.c.b.b Fam005727.B.c.b.a Fam008041.a.b Fam009651.b.b Fam012743.a Fam007718.b Click to show this node (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) Click to hide this line (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) 28_Amniota - block_9 Fam012266.b.a Fam012399.b.a.a.a.b Fam007393.b.a Fam010055 Fam011868.b.a.b.b Fam005930.b Fam012842.b Fam000398.A.a Fam005436.BE.b Fam008952.b.b Fam008115.a Fam000798.b.b Fam012922.A Fam013094 Fam007718.b Fam012743.a Fam009651.b.b.b Fam008041.a.b Fam005727.B.c.b.a Fam005727.B.c.b.b Fam004824.H.a Fam009178.a.b Fam010706.b Fam010215.b.e Fam012376.c.a Fam005114.C.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a Fam004832.J Fam008731.b Fam005392.A.a.a Fam011438.E.a Click to hide this line (27_Euarchontoglires) 27_Euarchontoglires speciation node (click to collapse) 27_Euarchontoglires - block_2 Fam012266.b.a Fam012399.b.a.a.a.b Fam007393.b.a Fam010055 Fam011868.b.a.b.b Fam005930.b.b.a Fam012842.b Fam000398.A.a Fam005436.BE.b Fam008952.b.b Fam008115.a Fam000798.b.b Fam012922.A Fam013094 Fam007718.b Fam012743.a Fam009651.b.b.b Fam008041.a.b Fam005727.B.c.b.a Fam005727.B.c.b.b Fam007745.c Fam004824.H.a Fam009178.a.b Fam010706.b Fam010215.b.e Fam012376.c.a Fam005114.C.b.b.b.a.a.a.a.b Fam005114.C.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a Fam004832.J Fam008731.b Click to hide this line (Mmus) Mmus terminal node Mmus - Chr:13 Hspb3 (ENSMUSG00000051456) Arl15 (ENSMUSG00000042348) Ndufs4 (ENSMUSG00000021764) Fst (ENSMUSG00000021765) Mocs2 (ENSMUSG00000015536) Itga2 (ENSMUSG00000015533) Itga1 (ENSMUSG00000042284) Pelo (ENSMUSG00000042275) Isl1 (ENSMUSG00000042258) Parp8 (ENSMUSG00000021725) Gm17509 (ENSMUSG00000091423) Emb (ENSMUSG00000021728) Hcn1 (ENSMUSG00000021730) Mrps30 (ENSMUSG00000021731) B430218F22Rik (ENSMUSG00000097411) Nnt (ENSMUSG00000025453) Paip1 (ENSMUSG00000025451) 4833420G17Rik (ENSMUSG00000062822) 3110070M22Rik (ENSMUSG00000074635) Tmem267 (ENSMUSG00000074634) ENSMUSG00000094114 Ccl28 (ENSMUSG00000074715) Hmgcs1 (ENSMUSG00000093930) Nim1k (ENSMUSG00000095930) Zfp131 (ENSMUSG00000094870) AF067063 (ENSMUSG00000094237) D13Ertd608e (ENSMUSG00000095514) Tcstv1 (ENSMUSG00000096284) Gm21761 (ENSMUSG00000096175) B020031M17Rik (ENSMUSG00000078537) Click to hide this line (Hsap) Hsap terminal node Hsap - Chr:5 OXCT1 (ENSG00000083720) C5orf51 (ENSG00000205765) FBXO4 (ENSG00000151876) GHR (ENSG00000112964) CCDC152 (ENSG00000198865) SELENOP (ENSG00000250722) ANXA2R (ENSG00000177721) ZNF131 (ENSG00000172262) NIM1K (ENSG00000177453) HMGCS1 (ENSG00000112972) CCL28 (ENSG00000151882) TMEM267 (ENSG00000151881) C5orf34 (ENSG00000172244) PAIP1 (ENSG00000172239) NNT (ENSG00000112992) MRPS30 (ENSG00000112996) HCN1 (ENSG00000164588) EMB (ENSG00000170571) PARP8 (ENSG00000151883) ISL1 (ENSG00000016082) ITGA1 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C5orf34 (ENSPSIG00000018245) PAIP1 (ENSPSIG00000018250) NNT (ENSPSIG00000018252) MRPS30 (ENSPSIG00000004270) HCN1 (ENSPSIG00000004384) ENSPSIG00000001645 EMB (ENSPSIG00000004449) PARP8 (ENSPSIG00000004455) ISL1 (ENSPSIG00000004593) PELO (ENSPSIG00000004971) ITGA1 (ENSPSIG00000005028) ENSPSIG00000006995 ENSPSIG00000007843 MOCS2 (ENSPSIG00000008636) FST (ENSPSIG00000009658) NDUFS4 (ENSPSIG00000010504) ARL15 (ENSPSIG00000010777) HSPB3 (ENSPSIG00000001656) Click to hide this line (Cmil) Cmil terminal node Cmil - scaffold_22 ARL15 (SINCAMG00000011260) NDUFS4 (SINCAMG00000011264) FST (SINCAMG00000011273) SCN5A (SINCAMG00000011282) MOCS2 (SINCAMG00000011318) ITGA2 (SINCAMG00000011330) ITGA1 (SINCAMG00000011354) ISL1 (SINCAMG00000011370) DTX3L (SINCAMG00000011373) PARP8 (SINCAMG00000011377) EMB (SINCAMG00000011384) NULL (SINCAMG00000018397) HCN1 (SINCAMG00000011389) MRPS30 (SINCAMG00000011394) NULL (SINCAMG00000018401) NNT (SINCAMG00000011399) Tars (SINCAMG00000011415) RUSC1 (SINCAMG00000011455) ATP8B2 (SINCAMG00000011467) UNC13B (SINCAMG00000011511) Click to show this node (31_Gnathostomata) 31_Gnathostomata speciation node (click to collapse) Click to hide this line (29_Sarcopterygii) 29_Sarcopterygii speciation node (click to collapse) 29_Sarcopterygii - block_799 Fam004824.H.b Fam011914.b.a Click to hide this line (Lcha) Lcha terminal node Lcha - Chr:JH126673.1 PLPPR3 (ENSLACG00000001511) ENSLACG00000003054 ENSLACG00000003632 ENSLACG00000005165 PALM (ENSLACG00000005984) ENSLACG00000022351 ENSLACG00000008512 ENSLACG00000008682 FSTL3 (ENSLACG00000009422) RNF126 (ENSLACG00000009793) POLRMT (ENSLACG00000011518) HCN2 (ENSLACG00000012418) ENSLACG00000013978 ENSLACG00000014913 ENSLACG00000015658 mbd3b (ENSLACG00000016232) MEX3D (ENSLACG00000016407) MBD3 (ENSLACG00000016498) ENSLACG00000016539 TCF3 (ENSLACG00000016589) ONECUT3 (ENSLACG00000017269) ATP8B3 (ENSLACG00000017414) REXO1 (ENSLACG00000017555) ENSLACG00000017601 FEM1A (ENSLACG00000017622) Click to hide this line (28_Amniota) 28_Amniota speciation node (click to collapse) 28_Amniota - block_96 Fam012102.C.b.b.a Fam009831.b.a.a Fam010926.b Fam012831.b.a.b Fam011420.b.b Fam010524.a.b Fam012585.b Fam011331 Fam011389.b.b.a Fam008373.e.a.b Fam004824.H.b.b Fam011914.b.a Fam011339.b Fam009651.a Fam012801.b.b.b.a Fam005114.C.b.b.b.a.a.b.b Fam003609.a Fam010822.a Fam012227.b.b Fam011181.A.b.b Fam008211.b.a.b.a.b Click to hide this line (27_Euarchontoglires) 27_Euarchontoglires speciation node (click to collapse) 27_Euarchontoglires - block_52 Fam012102.C.b.b.a Fam010926.b Fam012831.b.a.b Fam011420.b.b Fam010524.a.b Fam012585.b Fam011331 Fam005114.C.b.b.b.b Fam005114.C.b.b.a.b.a.b.b Fam005114.C.b.b.a.b.a.b.a Fam011389.b.b.a Fam008373.e.a.b Fam005114.C.b.b.a.b.b Fam004824.H.b.b Fam011914.b.a Fam011339.b Fam009651.a Fam012801.b.b.b.a Fam005114.C.b.b.b.a.a.b.b Fam003609.a.b Fam010822.a Fam013430.b.b.b Fam009216.a.a Fam013176.a.a Fam012227.b.b Fam011181.A.b.b Click to hide this line (Mmus) Mmus terminal node Mmus - Chr:10 Vmn2r82 (ENSMUSG00000091468) Vmn2r83 (ENSMUSG00000091381) Plpp2 (ENSMUSG00000052151) Mier2 (ENSMUSG00000042570) Theg (ENSMUSG00000020317) C2cd4c (ENSMUSG00000045912) Shc2 (ENSMUSG00000020312) Odf3l2 (ENSMUSG00000035963) Madcam1 (ENSMUSG00000020310) Tpgs1 (ENSMUSG00000020308) Cdc34 (ENSMUSG00000020307) Gzmm (ENSMUSG00000054206) Bsg (ENSMUSG00000023175) Hcn2 (ENSMUSG00000020331) Polrmt (ENSMUSG00000020329) Rnf126 (ENSMUSG00000035890) Fstl3 (ENSMUSG00000020325) Prss57 (ENSMUSG00000020323) Palm (ENSMUSG00000035863) Misp (ENSMUSG00000035852) Ptbp1 (ENSMUSG00000006498) Plppr3 (ENSMUSG00000035835) Prtn3 (ENSMUSG00000057729) Elane (ENSMUSG00000020125) Cfd (ENSMUSG00000061780) Med16 (ENSMUSG00000013833) R3hdm4 (ENSMUSG00000035781) Gm26602 (ENSMUSG00000097854) Kiss1r (ENSMUSG00000035773) Arid3a (ENSMUSG00000019564) Click to hide this line (Hsap) Hsap terminal node Hsap - Chr:19 OR4F17 (ENSG00000176695) PLPP2 (ENSG00000141934) MIER2 (ENSG00000105556) THEG (ENSG00000105549) C2CD4C (ENSG00000183186) SHC2 (ENSG00000129946) ODF3L2 (ENSG00000181781) MADCAM1 (ENSG00000099866) TPGS1 (ENSG00000141933) CDC34 (ENSG00000099804) GZMM (ENSG00000197540) BSG (ENSG00000172270) HCN2 (ENSG00000099822) POLRMT (ENSG00000099821) RNF126 (ENSG00000070423) FSTL3 (ENSG00000070404) PRSS57 (ENSG00000185198) PALM (ENSG00000099864) MISP (ENSG00000099812) PTBP1 (ENSG00000011304) PLPPR3 (ENSG00000129951) AZU1 (ENSG00000172232) PRTN3 (ENSG00000196415) ELANE (ENSG00000197561) CFD (ENSG00000197766) MED16 (ENSG00000175221) R3HDM4 (ENSG00000198858) KISS1R (ENSG00000116014) ARID3A (ENSG00000116017) Click to show this node (24_Archelosauria) 24_Archelosauria speciation node (click to collapse) Click to hide this line (Ggal) Ggal terminal node Ggal - Chr:28 SEMA6B (ENSGALG00000001171) ANKRD24 (ENSGALG00000001235) SIRT6 (ENSGALG00000001245) CREB3L3 (ENSGALG00000001252) MAP2K2 (ENSGALG00000001267) C2CD4C (ENSGALG00000001273) ENSGALG00000001289 ENSGALG00000001317 ENSGALG00000028341 TPGS1 (ENSGALG00000026780) CDC34 (ENSGALG00000024332) BSG (ENSGALG00000001328) HCN2 (ENSGALG00000001342) POLRMT (ENSGALG00000001377) ENSGALG00000001399 PALM (ENSGALG00000026055) ENSGALG00000001898 PTBP1 (ENSGALG00000001962) ENSGALG00000001969 ENSGALG00000027497 ARID3A (ENSGALG00000026231) WDR18 (ENSGALG00000021637) GRIN3B (ENSGALG00000026241) TMEM259 (ENSGALG00000002029) ENSGALG00000002453 CNN2 (ENSGALG00000027777) ENSGALG00000002559 POLR2E (ENSGALG00000002591) ENSGALG00000002595 Cirobu.g00004540 (KH.C2.350) Cirobu.g00004172,EFCAB8,WDR49,WDR64 (KH.C2.1053) Fam005192.C.b Fam005192.C.b Fam005192.C.b Cirobu.g00004295,FGF16,FGF20,FGF9 (KH.C2.125) Cisavi.g00003434,ENSCSAVG00000005620,FGF16,FGF20,FGF9 (Cisavi.CG.ENS81.R17.698380-701770) Fam005192.C.b Phmamm.g00003805,FGF16,FGF20,FGF9 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03805) Phfumi.g00006431,FGF16,FGF20,FGF9 (Phfumi.CG.MTP2014.S4550.g06431) Fam005192.C.b Moocul.g00002447,FGF16,FGF20,FGF9 (Moocul.CG.ELv1_2.S45502.g02447) 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Moocul.g00001266,FGF10,FGF5,FGF7 (Moocul.CG.ELv1_2.S27543.g01266) Fam005192.D.b.b Cirobu.g00014816,FGF4,FGF5,FGF6 (KH.S615.3) Fam005192.D.b.b Boleac.g00010408,FGF4,FGF5,FGF6 (Boleac.CG.SB_v3.S479.g10408) Boschl.g00066473,FGF16,FGF6,FGF9 (Boschl.CG.Botznik2013.chr9.g66473) Fam005192.D.b.c FGF5 (SINCAMG00000015004) Fam005192.D.b.c FGF5 (ENSLACG00000014672) Fam005192.D.b.c.a.a ENSGALG00000010893 Fgf5 (ENSMUSG00000029337) FGF5 (ENSG00000138675) FGF5 (ENSPSIG00000017772) fgf4-b (SINCAMG00000009176) Fam005192.D.b.d.b.a Fam005192.D.b.d.b.a FGF6 (ENSLACG00000018038) Fam005192.D.b.d.b.a.a Fam005192.D.b.d.b.a.a FGF6 (ENSG00000111241) Fgf6 (ENSMUSG00000000183) FGF6 (ENSPSIG00000011299) FGF6 (ENSGALG00000017287) FGF6 (SINCAMG00000000069) Fam005192.E.a.b Fam005192.D.b.d.b.b.a FGF4 (ENSGALG00000007562) FGF3 (ENSGALG00000026853) Fam005192.D.b.d.b.b.a Fam005192.E.a.b Fgf3 (ENSMUSG00000031074) Fgf4 (ENSMUSG00000050917) FGF4 (ENSG00000075388) FGF3 (ENSG00000186895) Fam005192.D.b.d.b.b.b Fam005192.D.b.d.b.b.b Fam005192.E.a FGF3 (ENSPSIG00000008796) FGF4 (ENSPSIG00000009214) FGF3 (ENSLACG00000012317) FGF4 (ENSLACG00000012527) FGF3 (SINCAMG00000008018) fgf4-b (SINCAMG00000008023) Fam005192.E Fam005192.E BL23218 Bbel.109480895 Fam005192.E.a FGF3 (SINCAMG00000008018) fgf4-b (SINCAMG00000008023) Fam005192.D.b.d.b.b.b Fam005192.E.a FGF3 (ENSLACG00000012317) FGF4 (ENSLACG00000012527) FGF3 (ENSPSIG00000008796) FGF4 (ENSPSIG00000009214) Fam005192.E.a.b Fam005192.D.b.d.b.b.a Fam005192.D.b.d.b.b.a Fam005192.E.a.b Fgf3 (ENSMUSG00000031074) Fgf4 (ENSMUSG00000050917) FGF4 (ENSG00000075388) FGF3 (ENSG00000186895) FGF4 (ENSGALG00000007562) FGF3 (ENSGALG00000026853) Fam005192.E.b.a FGF7 (SINCAMG00000006486) Fam005192.E.b.a FGF7 (ENSLACG00000014240) Fam005192.E.b.a Fam005192.E.b.a FGF7 (ENSG00000140285) Fgf7 (ENSMUSG00000027208) Fam005192.E.b.a FGF7 (ENSPSIG00000009064) FGF7 (ENSGALG00000028158) Fam005192.E.b.b.a Fam005192.E.b.b.a Fam005192.E.b.b.a Fgf10 (ENSMUSG00000021732) FGF10 (ENSG00000070193) Fam005192.E.b.b.a FGF10 (ENSGALG00000014872) FGF10 (ENSPSIG00000004248) FGF10 (SINCAMG00000011395) Fam005192.E.b.b.b FGF22 (ENSLACG00000010370) Fam005192.E.b.b.b Fam005192.E.b.b.b Fgf22 (ENSMUSG00000020327) FGF22 (ENSG00000070388) ENSGALG00000001385 Fam009479 Fam009479 Fam009479 Cirobu.g00004739,MICU1,MICU2,MICU3 (KH.C2.531) Cisavi.g00003433,ENSCSAVG00000005606,MICU1,MICU2,MICU3 (Cisavi.CG.ENS81.R17.662082-675031) Fam009479 Phmamm.g00003803,MICU1,MICU2,MICU3 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03803) Fam009479 Moocul.g00002448,MICU1,MICU2,MICU3 (Moocul.CG.ELv1_2.S45502.g02448) Fam009479 Fam009479 Haaura.g00004901,MICU1,MICU2,MICU3 (Haaura.CG.MTP2014.S412.g04901) Harore.g00007906,MICU1,MICU2,MICU3 (Harore.CG.MTP2014.S81.g07906) Boleac.g00006314,MICU1,MICU2,MICU3 (Boleac.CG.SB_v3.S267.g06314) Fam009479 Fam009479.a MICU3 (ENSGALG00000013661) Fam009479.a MICU3 (ENSG00000155970) Micu3 (ENSMUSG00000039478) MICU3 (ENSPSIG00000011695) MICU3 (ENSLACG00000011706) EFHA2 (SINCAMG00000012424) Bbel.109487798 Cirobu.g00005175,PPM1A,PPM1B,PPM1G (KH.C2.930) Cirobu.g00005121,SLC36A1,SLC36A2,SLC36A3 (KH.C2.881) Phmamm.g00003806 (Phmamm.CG.MTP2014.S128.g03806) Cirobu.g00004297,ADRB1,GHSR,HRH2 (KH.C2.127) Cirobu.g00004210,ZC3HC1 (KH.C2.1088) Cirobu.g00005237,B3GALNT1,B3GALT1,B3GALT5 (KH.C2.988) Cirobu.g00004298,SDR39U1 (KH.C2.128) Cirobu.g00004543,CD2AP,FCHSD1,FCHSD2 (KH.C2.353) Cirobu.g00004136,JADE1,JADE2,JADE3 (KH.C2.1020) Cirobu.g00004244,CUBN,TLL1,TLL2 (KH.C2.1118) Cirobu.g00004166,UBE4A,UBE4B,UBOX5 (KH.C2.1048) Cirobu.g00004174,PLA2G1B,PLA2G2A,PLA2G2E (KH.C2.1055) Cirobu.g00005014,FLRT1,VASN (KH.C2.785) LRRC32 (SINCAMG00000016313) ENSGALG00000027587 Cirobu.g00005048,OSTM1 (KH.C2.815) Cirobu.g00004601,GLYR1,HIBADH,PSIP1 (KH.C2.406) Cirobu.g00004193,PHKA1,PHKA2,PHKB (KH.C2.1072) Fam008492.b Cirobu.g00004880,FBXL14,FBXL2,FBXL20 (KH.C2.66) Cirobu.g00004941,ADRB2,DRD5,GHSR (KH.C2.717) Cirobu.g00005005,DBH,MOXD1,PAM (KH.C2.777) Cirobu.g00004191,BMP1,CUBN,TLL2 (KH.C2.1070) Cirobu.g00004306,SLC7A1,SLC7A2,SLC7A4 (KH.C2.136) Cirobu.g00005235,BMP1,CUBN,TLL2 (KH.C2.986) Cirobu.g00004703,ARAP1,ARAP2,ARAP3 (KH.C2.5) Cirobu.g00005052,CORO7,CORO7-PAM16 (KH.C2.819) Cirobu.g00005179,BMP1,CUBN,TLL2 (KH.C2.934) Cirobu.g00004927,BMP1,CUBN,TLL2 (KH.C2.703) Cirobu.g00005081 (KH.C2.845) Cirobu.g00004141,ASGR2,MRC2,PKD1L2 (KH.C2.1025)